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基因測序技術(shù)偵破“跨國腹瀉案”

[2015/5/14]

  英國疾控部門一個快速反應(yīng)小組近日發(fā)表論文,還原了他們怎樣利用全基因組測序和食品溯源技術(shù),將一場跨國暴發(fā)的腸炎沙門氏菌疫情追溯到德國的一家禽蛋生產(chǎn)商。

  這次疫情最初發(fā)生在2014年5月~9月之間,涉及英國中部、西北部和南部的至少287個病例。同時,腸炎沙門氏菌疫情也在法國和奧地利出現(xiàn)。這三國樣本中得到的分離菌經(jīng)過多位點可變數(shù)目串聯(lián)重復(fù)序列分析((MLVA)后,發(fā)現(xiàn)屬同一種。此后,相似病例出現(xiàn)在盧森堡和德國。

  法國疫情最先被溯源到一家德國禽蛋生產(chǎn)商。進一步的溯源調(diào)查也顯示,其他疫情也同這家生產(chǎn)商有關(guān)。在這些國家的分離菌樣本都做了全基因組測序后,這一結(jié)論得到確認。